Virus Influenza Porcin (VIP), initiatives du Québec

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Principaux clades pour les sous-types H1 et H3 dans Octoflu (2019-2023)

Le nom des clades rapportés dans cette page sont ceux qui étaient inclus dans la base de données de référence de l'outil Octoflu entre 2019 et 2023 ¹⁾.

Dans la mise à jour récente, il y a eu quelques changements de certains noms de clades (ex: clade H1 alpha-3 devient le clade H1 alpha-del). Le système de classification actuel est accessible sur la page classification OctoFlu (2023).

Dans le tableau le premier nom correspond à l'identification du virus utilisé par le Canada, les États-Unis et le Mexique (Nom_CÉM). Le nom entre parenthèses est un système utilisé dans d'autres parties du monde tel que la communauté européenne (Nom_EU). Vous trouverez plus d'informations sur la page Clades et lignées.

	Nom_CÉM (nom_EU)	Nom_CÉM (nom_EU)
1	H1 alpha (1A.1.1)	H3 Cluster I «C_I » (3.1990.1)
2	H1 alpha2 (1A)	H3 Cluster IV «C_IV » (3.1990.4)
3	H1 alpha3 (1A.1.1)	H3 Cluster IVA «C_IVA » (3.1990.4.1)
4	H1 alpha3a (1A.1.1)	H3 Cluster IVB «C_IVB » (3.1990.4.2-3)
5	H1 beta (1A.2)	H3 Cluster IVC «C_IVC » (3.1990.4.4)
6	H1 delta1 (1B.2.2.2)	H3 Cluster IVD «C_IVD » (3.1990.4.5)
7	H1 delta2 (1B.2.1)	H3 Cluster IVE «C_IVE » (3.1990.4.6)
8	H1 delta-like (Other-Human-1B.2)	H3 Cluster IVF «C_IVF » (3.1990.4.7)
9	H1 gamma (1A.3.3.3)	H3 >2010-human_like (3.2010.1)
10	H1 gamma2 (1A.3.2)	H3 >2016-human_like (3.2010.2)
11	H1 pdm (1A.3.3.2)
12	H1 pdm-vaccine (1A.3.3.2)

¹⁾

Chang, J., Anderson, T.K., Zeller, M.A., Gauger, P.C., and Vincent, A.L. (2019). “octoFLU: Automated classification to evolutionary origin of influenza A virus gene sequences detected in U.S. swine” Microbiology Resource Announcements 8(32), e00673-19. L'outil est disponible en mode «Open Source» sur GitHUB.