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methodologie_portrait [2020/08/28 07:52] Christian Klopfensteinmethodologie_portrait [2023/09/24 14:09] (Version actuelle) Christian Klopfenstein
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-===== Méthodologies =====+===== Classification des virus (H1|H3) =====
  
 ==== Méthodes des sous-types (H|N) ==== ==== Méthodes des sous-types (H|N) ====
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 |11|  |H3-CI (vaccin vivant atténué)| |11|  |H3-CI (vaccin vivant atténué)|
  
-===== Références pour les clades H1 et H3 =====+=== Références pour les clades H1 et H3 ===
  
 **Clades pour les virus influenza porcins sous-types H1** **Clades pour les virus influenza porcins sous-types H1**
-Les articles suivants décrivent les principaux clades de référence pour le sous-type H1 du virus influenza porcin.  Ces clades de référence pour H1 ([[influenza_abc_clades#principaux_clades_pour_les_sous-types_h1_et_h3 |voir tableau plus loin]])\\+Les articles suivants décrivent les principaux clades de référence pour le sous-type H1 du virus influenza porcin.   
 [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5156671/|A Phylogeny-Based Global Nomenclature System and Automated Annotation Tool for H1 Hemagglutinin Genes from Swine Influenza A Viruses (2016)]] ((Anderson TK, Macken CA, Lewis NS, et al. A Phylogeny-Based Global Nomenclature System and Automated Annotation Tool for H1 Hemagglutinin Genes from Swine Influenza A Viruses. mSphere. 2016;1(6):e00275-16. Published 2016 Dec 14. doi:10.1128/mSphere.00275-16))\\ [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5156671/|A Phylogeny-Based Global Nomenclature System and Automated Annotation Tool for H1 Hemagglutinin Genes from Swine Influenza A Viruses (2016)]] ((Anderson TK, Macken CA, Lewis NS, et al. A Phylogeny-Based Global Nomenclature System and Automated Annotation Tool for H1 Hemagglutinin Genes from Swine Influenza A Viruses. mSphere. 2016;1(6):e00275-16. Published 2016 Dec 14. doi:10.1128/mSphere.00275-16))\\
 [[https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682218300436|Antigenic and genetic evolution of contemporary swine H1 influenza viruses in the United States (2018)]] [[https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682218300436|Antigenic and genetic evolution of contemporary swine H1 influenza viruses in the United States (2018)]]
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 ((Walia RR, Anderson TK, Vincent AL. Regional patterns of genetic diversity in swine influenza A viruses in the United States from 2010 to 2016. Influenza Other Respir Viruses. 2019;13(3):262-273. doi:10.1111/irv.12559)) ((Walia RR, Anderson TK, Vincent AL. Regional patterns of genetic diversity in swine influenza A viruses in the United States from 2010 to 2016. Influenza Other Respir Viruses. 2019;13(3):262-273. doi:10.1111/irv.12559))
  
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 ===== Système de classification automatisé des séquences du virus influenza porcin (Octoflu) ===== ===== Système de classification automatisé des séquences du virus influenza porcin (Octoflu) =====
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 [[https://mra.asm.org/content/8/32/e00673-19|Octoflu: Automated Classification for the Evolutionary Origin of Influenza A Virus Gene Sequences Detected in U.S. Swine (2019)]] ((Chang J, Anderson TK, Zeller MA, Gauger PC, Vincent AL. octoFLU: Automated Classification for the Evolutionary Origin of Influenza A Virus Gene Sequences Detected in U.S. Swine. Microbiol Resour Announc. 2019;8(32):e00673-19. Published 2019 Aug 8. doi:10.1128/MRA.00673-19)) [[https://mra.asm.org/content/8/32/e00673-19|Octoflu: Automated Classification for the Evolutionary Origin of Influenza A Virus Gene Sequences Detected in U.S. Swine (2019)]] ((Chang J, Anderson TK, Zeller MA, Gauger PC, Vincent AL. octoFLU: Automated Classification for the Evolutionary Origin of Influenza A Virus Gene Sequences Detected in U.S. Swine. Microbiol Resour Announc. 2019;8(32):e00673-19. Published 2019 Aug 8. doi:10.1128/MRA.00673-19))
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methodologie_portrait.1598615564.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/28 07:52 de Christian Klopfenstein

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